在数据科学、统计分析和机器学习领域,R 语言凭借其强大的社区支持和丰富的包生态系统,占据了举足轻重的地位,CentOS 7 则以其稳定性和可靠性,成为许多服务器和企业环境的首选操作系统,将这两者结合,构建一个强大且稳定的数据分析平台,是许多开发者和数据科学家的常见需求,本文将详细介绍如何在 CentOS 7 系统上安装、配置和管理 R 语言环境,确保您能够顺利开启数据分析之旅。
准备工作:更新系统与安装依赖
在开始安装 R 之前,一个干净、更新的系统环境是成功的一半,这可以避免许多因依赖缺失或版本过旧导致的潜在问题。
通过 SSH 连接到您的 CentOS 7 服务器,然后执行以下命令来更新所有系统软件包到最新版本:
sudo yum update -y
安装编译 R 语言及其某些包所必需的开发工具和库,这些工具包括 C/C++ 编译器、make
工具以及用于处理压缩和数据格式的库。
sudo yum groupinstall -y "Development Tools" sudo yum install -y gcc gcc-c++ glibc-devel libcurl-devel openssl-devel zlib-devel bzip2-devel readline-devel libpng-devel libjpeg-turbo-devel texinfo
完成这些准备工作后,您的系统就已经为安装 R 语言做好了充分的准备。
安装 R 语言:两种主流方法
在 CentOS 7 上安装 R 主要有两种方法:通过 EPEL (Extra Packages for Enterprise Linux) 仓库安装,或通过配置官方的 CRAN (Comprehensive R Archive Network) 仓库安装,两种方法各有优劣,适用于不同的场景。
使用 EPEL 仓库(推荐新手)
EPEL 是由 Fedora 社区维护的,为 RHEL 系列系统(包括 CentOS)提供高质量附加软件包的仓库,通过 EPEL 安装 R 是最简单、最快捷的方式。
安装 EPEL 仓库:
sudo yum install -y epel-release
安装 R 语言:
sudo yum install -y R
这种方法的优点在于安装过程简单,依赖关系由 yum
自动处理,且版本相对稳定,缺点是 EPEL 仓库中的 R 版本可能不是最新的,对于需要最新功能的用户来说可能不够用。
配置 CRAN 仓库(推荐追求最新版本的用户)
为了获取 R 语言的最新稳定版,可以直接配置 CRAN 的官方仓库。
启用 PowerTools 仓库(某些依赖可能需要):
sudo yum-config-manager --enable powertools
创建 CRAN 仓库配置文件:
使用vi
或nano
编辑器创建一个新的仓库文件。sudo vi /etc/yum.repos.d/r.repo
在文件中添加以下内容:
(请根据您的 CentOS 版本选择合适的路径,此处以 CentOS 7 为例)[R-base] name=R for CentOS 7 - CRAN baseurl=https://cran.rstudio.com/bin/linux/centos7/ enabled=1 gpgcheck=1 gpgkey=https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/archive.key
安装 R 语言:
保存并关闭文件后,清理yum
缓存并安装 R。sudo yum clean all sudo yum install -y R
两种方法对比
特性 | EPEL 仓库 | CRAN 仓库 |
---|---|---|
安装简易度 | 非常简单 | 稍复杂(需手动配置) |
版本新旧 | 相对滞后 | 最新稳定版 |
稳定性 | 高,经过充分测试 | 高,但新版本可能引入未知问题 |
适用人群 | 新手、追求稳定的企业环境 | 需要最新功能的研究人员、开发者 |
验证安装与基本使用
安装完成后,可以通过以下命令验证 R 是否已成功安装并查看其版本:
R --version
您应该会看到类似 R version 4.x.x (...)
的输出,启动 R 交互式控制台进行简单的测试:
R
进入 R 控制台后,您可以执行一些简单的 R 命令:
# 打印欢迎信息 print("Hello, CentOS 7!") # 进行数学计算 result <- 2 + 2 print(result) # 退出 R 控制台 q()
安装和管理 R 包
R 的强大之处在于其海量的扩展包,安装和管理包是日常工作的核心。
在 R 控制台中安装
这是最常见的方式,以安装流行的数据可视化包 ggplot2
为例:
- 启动 R 控制台:
R
- 执行安装命令:
install.packages("ggplot2")
- 系统可能会提示您选择一个 CRAN 镜像,选择一个地理位置最近的即可。
- 安装完成后,使用
library()
函数加载包:library(ggplot2)
通过命令行安装(自动化脚本友好)
在服务器环境中,通常需要在脚本中自动化安装包,可以使用 -e
参数让 R 直接执行命令:
sudo R -e "install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')"
使用 sudo
可以将包安装到系统目录,供所有用户使用,如果只为当前用户安装,则无需 sudo
。
相关问答 FAQs
问题1:如何更新已安装的 R 语言版本?
解答: 更新 R 的方式取决于您最初是如何安装它的。
- 如果您是通过 EPEL 仓库 或 CRAN 仓库 安装的,更新过程非常简单,只需运行系统更新命令,
yum
会自动检查并更新 R 到仓库中的最新版本,执行sudo yum update R
即可。 - 如果您是从源代码编译安装的(本文未涵盖),更新过程会复杂一些,需要下载新版本的源代码,重新编译并安装,这可能会覆盖旧版本,通常建议通过包管理器安装,以便于管理更新。
问题2:R 包默认安装在哪里?如何修改安装路径?
解答: R 包的安装路径主要取决于您是否有管理员权限。
- 默认路径:当您使用
sudo
安装包时,它们通常被安装在系统级的路径下,如/usr/lib64/R/library/
,当普通用户(无sudo
)安装包时,R 会提示您是否创建一个个人库,通常位于用户的家目录下,如~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/x.x/
。 - 查看路径:您可以在 R 控制台中输入
.libPaths()
命令来查看当前包的搜索路径列表。 - 修改路径:要永久更改个人库的路径,可以设置环境变量
R_LIBS_USER
,在您的~/.bashrc
或~/.bash_profile
文件中添加export R_LIBS_USER="~/my_R_packages"
,然后执行source ~/.bashrc
使之生效,这样,之后为该用户安装的包都会存放在这个新目录中。
【版权声明】:本站所有内容均来自网络,若无意侵犯到您的权利,请及时与我们联系将尽快删除相关内容!
发表回复